Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC24Q8N4L8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC24Q8N4L8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms