Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C17orf53Q8N3J3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf53Q8N3J3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms