Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms