Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA4Q8IV77 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms