Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCA5Q86VQ0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms