Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms