Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZD4Q76G19 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZD4Q76G19 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms