Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM43BQ6ZT52 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms