Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBR3Q6ZT12 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
UBR3Q6ZT12 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
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