Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP6Q6ZN66 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms