Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC1Q6TDU7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC1Q6TDU7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms