Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms