Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDB4

ZNF880, Zinc finger protein 880, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF880Q6PDB4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF880Q6PDB4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms