Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms