Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms