Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPANXN1Q5VSR9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms