Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAT1Q5SQI0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms