Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL8

PDZD11, PDZ domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD11Q5EBL8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDZD11Q5EBL8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PDZD11Q5EBL8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms