Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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CNGA3Q16281 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNGA3Q16281 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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