Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MED1Q15648 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MED1Q15648 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MED1Q15648 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MED1Q15648 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MED1Q15648 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MED1Q15648 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MED1Q15648 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MED1Q15648 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MED1Q15648 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MED1Q15648 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MED1Q15648 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED1Q15648 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MED1Q15648 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED1Q15648 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED1Q15648 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED1Q15648 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED1Q15648 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED1Q15648 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MED1Q15648 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED1Q15648 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED1Q15648 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED1Q15648 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED1Q15648 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED1Q15648 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED1Q15648 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED1Q15648 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MED1Q15648 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MED1Q15648 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MED1Q15648 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MED1Q15648 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MED1Q15648 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MED1Q15648 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MED1Q15648 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MED1Q15648 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MED1Q15648 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MED1Q15648 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MED1Q15648 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED1Q15648 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED1Q15648 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED1Q15648 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED1Q15648 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED1Q15648 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED1Q15648 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED1Q15648 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED1Q15648 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED1Q15648 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED1Q15648 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED1Q15648 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED1Q15648 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED1Q15648 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MED1Q15648 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED1Q15648 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED1Q15648 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED1Q15648 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED1Q15648 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED1Q15648 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED1Q15648 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED1Q15648 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED1Q15648 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED1Q15648 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED1Q15648 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED1Q15648 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED1Q15648 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED1Q15648 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED1Q15648 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED1Q15648 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED1Q15648 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED1Q15648 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED1Q15648 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED1Q15648 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED1Q15648 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED1Q15648 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED1Q15648 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED1Q15648 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED1Q15648 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED1Q15648 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MED1Q15648 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED1Q15648 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MED1Q15648 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MED1Q15648 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MED1Q15648 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MED1Q15648 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MED1Q15648 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms