Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP1Q15431 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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