Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPHQ15003 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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