Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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ODF1Q14990 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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ODF1Q14990 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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ODF1Q14990 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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ODF1Q14990 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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ODF1Q14990 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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