Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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