Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms