Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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UBE4AQ14139 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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UBE4AQ14139 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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UBE4AQ14139 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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UBE4AQ14139 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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UBE4AQ14139 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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UBE4AQ14139 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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UBE4AQ14139 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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UBE4AQ14139 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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UBE4AQ14139 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
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