Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CDK13Q14004 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
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