Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKP1Q13835 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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