Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CUL3Q13618 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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