Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRQ13535 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRQ13535 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRQ13535 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRQ13535 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRQ13535 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRQ13535 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRQ13535 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRQ13535 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRQ13535 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRQ13535 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRQ13535 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRQ13535 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRQ13535 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ATRQ13535 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRQ13535 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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