Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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