Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMAN2Q12907 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms