Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms