Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms