Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms