Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATP7AQ04656 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATP7AQ04656 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms