Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX3P78415 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX3P78415 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRX3P78415 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRX3P78415 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX3P78415 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX3P78415 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX3P78415 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX3P78415 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX3P78415 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX3P78415 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX3P78415 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX3P78415 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX3P78415 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX3P78415 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX3P78415 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX3P78415 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX3P78415 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX3P78415 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX3P78415 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX3P78415 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX3P78415 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX3P78415 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX3P78415 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX3P78415 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX3P78415 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX3P78415 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX3P78415 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX3P78415 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX3P78415 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX3P78415 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX3P78415 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX3P78415 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX3P78415 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX3P78415 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX3P78415 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX3P78415 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX3P78415 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms