Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBBP68871 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBBP68871 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms