Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP6P59044 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP6P59044 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP6P59044 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP6P59044 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP6P59044 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP6P59044 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP6P59044 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP6P59044 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP6P59044 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP6P59044 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP6P59044 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP6P59044 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP6P59044 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP6P59044 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP6P59044 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP6P59044 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP6P59044 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP6P59044 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP6P59044 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP6P59044 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP6P59044 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP6P59044 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP6P59044 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP6P59044 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP6P59044 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP6P59044 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP6P59044 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NLRP6P59044 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP6P59044 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP6P59044 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP6P59044 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP6P59044 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP6P59044 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP6P59044 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP6P59044 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP6P59044 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP6P59044 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP6P59044 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP6P59044 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP6P59044 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP6P59044 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP6P59044 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP6P59044 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP6P59044 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP6P59044 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP6P59044 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NLRP6P59044 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP6P59044 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP6P59044 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP6P59044 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms