Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAX9P55771 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAX9P55771 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAX9P55771 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAX9P55771 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAX9P55771 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX9P55771 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX9P55771 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAX9P55771 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX9P55771 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX9P55771 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX9P55771 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX9P55771 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX9P55771 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX9P55771 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX9P55771 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAX9P55771 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms