Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP7P55210 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP7P55210 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP7P55210 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP7P55210 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP7P55210 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASP7P55210 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASP7P55210 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP7P55210 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP7P55210 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP7P55210 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP7P55210 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP7P55210 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP7P55210 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP7P55210 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP7P55210 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP7P55210 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP7P55210 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP7P55210 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP7P55210 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP7P55210 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP7P55210 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP7P55210 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP7P55210 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP7P55210 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP7P55210 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP7P55210 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP7P55210 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP7P55210 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP7P55210 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP7P55210 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP7P55210 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP7P55210 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP7P55210 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP7P55210 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP7P55210 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP7P55210 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP7P55210 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP7P55210 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP7P55210 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP7P55210 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms