Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms