Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ1P51787 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ1P51787 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ1P51787 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ1P51787 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ1P51787 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ1P51787 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ1P51787 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ1P51787 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNQ1P51787 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms