Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms