Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB5CP51148 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5CP51148 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5CP51148 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5CP51148 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5CP51148 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5CP51148 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5CP51148 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5CP51148 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5CP51148 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5CP51148 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5CP51148 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5CP51148 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5CP51148 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5CP51148 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5CP51148 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms