Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK7P50613 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK7P50613 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK7P50613 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK7P50613 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK7P50613 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK7P50613 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK7P50613 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK7P50613 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK7P50613 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK7P50613 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK7P50613 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK7P50613 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK7P50613 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK7P50613 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK7P50613 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK7P50613 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK7P50613 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK7P50613 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK7P50613 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK7P50613 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK7P50613 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK7P50613 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK7P50613 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK7P50613 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK7P50613 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK7P50613 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK7P50613 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK7P50613 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK7P50613 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK7P50613 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK7P50613 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK7P50613 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK7P50613 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK7P50613 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK7P50613 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK7P50613 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK7P50613 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK7P50613 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK7P50613 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK7P50613 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK7P50613 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK7P50613 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK7P50613 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK7P50613 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK7P50613 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK7P50613 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK7P50613 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK7P50613 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK7P50613 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK7P50613 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms