Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRXP46100 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRXP46100 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRXP46100 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRXP46100 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRXP46100 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRXP46100 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRXP46100 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRXP46100 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRXP46100 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRXP46100 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRXP46100 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRXP46100 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRXP46100 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRXP46100 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRXP46100 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRXP46100 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRXP46100 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRXP46100 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRXP46100 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRXP46100 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRXP46100 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRXP46100 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRXP46100 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRXP46100 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRXP46100 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRXP46100 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRXP46100 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRXP46100 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRXP46100 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRXP46100 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRXP46100 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRXP46100 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRXP46100 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRXP46100 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRXP46100 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRXP46100 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRXP46100 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRXP46100 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRXP46100 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRXP46100 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRXP46100 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRXP46100 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRXP46100 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRXP46100 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRXP46100 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
ATRXP46100 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATRXP46100 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATRXP46100 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATRXP46100 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATRXP46100 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATRXP46100 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATRXP46100 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms