Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP62P37198 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUP62P37198 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUP62P37198 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NUP62P37198 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP62P37198 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms