Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms