Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4P34932 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms